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据我个人的不完全调查,可以实现森林图的有: Meta分析专用软件RevMan 通用统计软件SAS/Sata/R 专用绘图软件GraphPad Prism 大众情人Excel 对于传统的Meta分析里的森林图,在RevMan里填好数据就自动生成了,市面上汗牛充栋的Meta分析培训班也就专门教这个,在此不再赘述。当然,这种传统森林图用Stata的metan命令和R的Meta和Metafor包也能轻松搞定,不太了解的可以戳这篇文章,在此也不再赘述。 Meta 分析的10个问题:从理论概念到编程实践 SAS其实通过GTL也能做出图文混排的森林图,不过比较复杂,我个人不推荐。但你就是好这口的话,我曾修过一个宏,这篇文章里,有过提及,也不再赘述。 多图预警:如何又快又美地用SAS画各种统计图形? 都不再赘述?那今天述啥?今天给大家展示: 如何用大众情人EXCEL搞定期刊风格的亚组分析森林图! (三)Excel开挂 比如说,顶级医学期刊NEJM的亚组分析森林图的风格如下: ↑NEJM亚组分析森林图的部分截图 分析:难点就在于如何画出HR及其95%CI,并整合到表格中去。 思路: 做好表格,空出Hazard Ratio(95%CI)栏的图的位置。 做好Hazard Ratio(95%CI)的图。 把Hazard Ratio(95%CI)的图贴到表格中去。 是的,这和把大象放进冰箱的思路是一样的。怎么做?转备好截图的疯狂轰炸! 1. 做好表格,留空位置;准备辅助数据,画图。 ↑模板示例 辅助数据包括: 标明行号的id列(倒序,以后当做y轴数据用) 效应值及其95%CI(hr, lhr,uhr) 95%CI上下限距离点估计的距离(ler,uer) 无效线列(ref, 通常为0或1,看效应指标是差值还是比值) 2. 插入一个空的散点图。 ↑空散点图 3. 右击空图,添加数据,把点估计的效应HR的散点画出来。 注意HR要作为X轴,ID作为y轴。 ↑点估计效应的散点图 4. 单击散点,出现加号,仅勾选坐标轴,设置误差线。 注意:13版可能有所差别。 ↑设置误差线 5. 用Uer和Ler列分别作为误差线的上限,下限值。 ↑继续设置误差线 6. EXEL默认会自动添加固定的纵向误差线,删除他,并对点,线,坐标轴做些设置。 ↑删除纵向误差线 ↑设置横坐标轴 ↑设置效应点,默认圆点,改为正方形 ↑初具雏形 7. 添加无效线。右击图后选择数据,Ref列作为X轴,ID列作为Y轴。 ↑添加无效线 但是不对啊?这是无效散点啊。 8. 格式化改点为线。 ↑格式化无效线 9. 删除Y轴数字标签。调整大小,宽度,移到备用的表格中。 ↑八九打扮,九分模样 等等,发现好像哪里不对?是的,要设置透明图片。 10. 设置图片透明。 ↑貌似OK 好像还是不对,怎么还有两条竖线线? 11. 设置无边框图片。 (四)皆大欢喜 经过11步大法,成品如下!基本可以出手了。再截图,再导出矢量图片,等等。后续你爱怎么折腾就怎么折腾吧。 哎,等等,怎么又是个11步啊,难道还要过一个双十一啊。哎,…… ↑可以出手了 (五)众口难调 不愿意码代码的童鞋,各位临床大大说,「太好了,EXCEL酷毙了,我要投NEJM!」 不愿动手的码农说,「太TMD的麻烦了吧,有没有简单的代码版的啊?」 其实,其实R的forestplot函数也是可以的。当然,其中也是有各种坑,各种小技巧,在此不再赘述。 R版的三行代码效果如下图: (六)读者福利 最近事儿比较多,写得懒了,前几篇文章放水太多,今天给的这个干货你打几分?打几分? 关注StatsThinking,后台回复「ExlMeta」 我给你推送Excel模板。以后有图,你直接往模板里填数据就可以了。 时间紧了,写得少了,截图太累了,写完这篇我要休息几天。大家且看且珍惜吧! 版权说明: 感谢支持鼓励,形式包括不限于转发,转载,推荐,赞赏。 微信公众平台的 非商业培训机构公众号,无需授权,可直接转载。 网站转载,不得省略作者信息,包括公众号二维码。 内容转载自公众号 StatsThinking 了解更多返回搜狐,查看更多 |
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